index
:
portage
edge
master
next
Portage tree snapshot
Redcore Linux Project
summary
refs
log
tree
commit
diff
log msg
author
committer
range
path:
root
/
metadata
/
md5-cache
/
sci-biology
Mode
Name
Size
-rw-r--r--
ApE-2.0.7-r1
742
log
plain
-rw-r--r--
GBrowse-2.48-r1
2232
log
plain
-rw-r--r--
HTSeq-0.9.1
3853
log
plain
-rw-r--r--
HTSeq-9999
3857
log
plain
-rw-r--r--
Manifest.gz
32638
log
plain
-rw-r--r--
STAR-2.5.3a
531
log
plain
-rw-r--r--
aaindex-9.1-r1
386
log
plain
-rw-r--r--
abyss-2.0.2-r1
1040
log
plain
-rw-r--r--
allpathslg-52488-r2
1183
log
plain
-rw-r--r--
amap-2.2-r3
1131
log
plain
-rw-r--r--
amos-3.1.0-r3
1635
log
plain
-rw-r--r--
arb-6.0.6
1050
log
plain
-rw-r--r--
ariadne-1.3-r3
497
log
plain
-rw-r--r--
augustus-2.5.5
632
log
plain
-rw-r--r--
bamtools-2.5.1
1218
log
plain
-rw-r--r--
bamtools-9999
1170
log
plain
-rw-r--r--
bcftools-1.5
1053
log
plain
-rw-r--r--
beast-mcmc-1.7.5-r1
1436
log
plain
-rw-r--r--
beast-mcmc-9999
1506
log
plain
-rw-r--r--
bedtools-2.26.0
1109
log
plain
-rw-r--r--
bfast-0.7.0a
1024
log
plain
-rw-r--r--
biogrep-1.0-r2
803
log
plain
-rw-r--r--
biopandas-0.1.4
3667
log
plain
-rw-r--r--
biopandas-0.2.1
4208
log
plain
-rw-r--r--
bioperl-1.6.9
2629
log
plain
-rw-r--r--
bioperl-9999-r1
2370
log
plain
-rw-r--r--
bioperl-db-1.6.9
1282
log
plain
-rw-r--r--
bioperl-db-1.6.9-r1
873
log
plain
-rw-r--r--
bioperl-db-9999-r1
1050
log
plain
-rw-r--r--
bioperl-network-1.6.9
1105
log
plain
-rw-r--r--
bioperl-network-9999-r1
1048
log
plain
-rw-r--r--
bioperl-run-1.6.9
1278
log
plain
-rw-r--r--
bioperl-run-9999-r1
1187
log
plain
-rw-r--r--
biopython-1.68
4664
log
plain
-rw-r--r--
bioruby-1.4.3.0001-r1
1572
log
plain
-rw-r--r--
bioruby-1.5.1
2131
log
plain
-rw-r--r--
biosql-1.0.1-r1
435
log
plain
-rw-r--r--
blat-34-r2
413
log
plain
-rw-r--r--
blossoc-1.4.0-r1
819
log
plain
-rw-r--r--
bowtie-1.1.2-r1
831
log
plain
-rw-r--r--
bowtie-2.2.9
581
log
plain
-rw-r--r--
bwa-0.7.16a
437
log
plain
-rw-r--r--
cd-hit-4.6.6
821
log
plain
-rw-r--r--
clustal-omega-1.2.4
700
log
plain
-rw-r--r--
clustalw-1.83-r4
499
log
plain
-rw-r--r--
clustalw-2.1-r1
343
log
plain
-rw-r--r--
clustalw-mpi-0.13-r2
560
log
plain
-rw-r--r--
clustalx-2.1-r1
918
log
plain
-rw-r--r--
clustalx-2.1-r2
882
log
plain
-rw-r--r--
consed-29
985
log
plain
-rw-r--r--
cufflinks-2.2.1-r2
2004
log
plain
-rw-r--r--
cutg-160-r1
431
log
plain
-rw-r--r--
dialign-tx-1.0.2-r2
433
log
plain
-rw-r--r--
dialign2-2.2.1
766
log
plain
-rw-r--r--
diya-1.0_rc4
1194
log
plain
-rw-r--r--
elph-1.0.1-r1
443
log
plain
-rw-r--r--
embassy-6.6.0-r1
880
log
plain
-rw-r--r--
embassy-cbstools-1.0.0.660
1681
log
plain
-rw-r--r--
embassy-clustalomega-1.1.0.660
1714
log
plain
-rw-r--r--
embassy-domainatrix-0.1.660
1677
log
plain
-rw-r--r--
embassy-domalign-0.1.660
1672
log
plain
-rw-r--r--
embassy-domsearch-0.1.660
1671
log
plain
-rw-r--r--
embassy-emnu-1.05.660
1702
log
plain
-rw-r--r--
embassy-esim4-1.0.0.660
1671
log
plain
-rw-r--r--
embassy-hmmer-2.3.2.660
1702
log
plain
-rw-r--r--
embassy-iprscan-4.3.1.660
1691
log
plain
-rw-r--r--
embassy-meme-4.7.660
1695
log
plain
-rw-r--r--
embassy-mse-3.0.0.660
1705
log
plain
-rw-r--r--
embassy-phylipnew-3.69.660
1677
log
plain
-rw-r--r--
embassy-signature-0.1.660
1667
log
plain
-rw-r--r--
embassy-structure-0.1.660
1667
log
plain
-rw-r--r--
embassy-topo-2.0.660
1667
log
plain
-rw-r--r--
embassy-vienna-1.7.2.660
1678
log
plain
-rw-r--r--
emboss-6.6.0-r1
1780
log
plain
-rw-r--r--
eugene-4.1d
740
log
plain
-rw-r--r--
exonerate-2.2.0-r2
820
log
plain
-rw-r--r--
express-0.9.5-r1
1121
log
plain
-rw-r--r--
express-1.5.1
1209
log
plain
-rw-r--r--
fasta-36.3.5e
873
log
plain
-rw-r--r--
fasttree-2.1.7
1291
log
plain
-rw-r--r--
fasttree-2.1.8
1293
log
plain
-rw-r--r--
finchtv-1.3.1-r2
314
log
plain
-rw-r--r--
finchtv-1.3.1-r3
667
log
plain
-rw-r--r--
foldingathome-7.4.4-r2
964
log
plain
-rw-r--r--
gatk-2.4
1140
log
plain
-rw-r--r--
gatk-9999
1062
log
plain
-rw-r--r--
gibbs-3.1
1061
log
plain
-rw-r--r--
glimmer-3.02-r3
686
log
plain
-rw-r--r--
glimmer-3.02b
695
log
plain
-rw-r--r--
glimmerhmm-3.0.1-r1
674
log
plain
-rw-r--r--
gmap-2015.12.31.5
401
log
plain
-rw-r--r--
goby-1.9.7.3-r1
1645
log
plain
-rw-r--r--
goby-1.9.8.1-r1
1645
log
plain
-rw-r--r--
goby-cpp-1.9.7.3
784
log
plain
-rw-r--r--
goby-cpp-1.9.8.1
784
log
plain
-rw-r--r--
goby-cpp-2.0.1
1191
log
plain
-rw-r--r--
hmmer-2.3.2-r4
346
log
plain
-rw-r--r--
hmmer-3.1_beta2
498
log
plain
-rw-r--r--
iedera-1.05-r1
633
log
plain
-rw-r--r--
infernal-1.0.2-r1
339
log
plain
-rw-r--r--
iqpnni-3.3.2-r1
287
log
plain
-rw-r--r--
kalign-2.03-r2
390
log
plain
-rw-r--r--
kallisto-0.43.1
1096
log
plain
-rw-r--r--
kallisto-9999
1024
log
plain
-rw-r--r--
lagan-2.0-r3
455
log
plain
-rw-r--r--
last-230
637
log
plain
-rw-r--r--
last-299-r1
910
log
plain
-rw-r--r--
mafft-7.050
802
log
plain
-rw-r--r--
mafft-7.215
804
log
plain
-rw-r--r--
mafft-7.305
804
log
plain
-rw-r--r--
maq-0.7.1-r2
744
log
plain
-rw-r--r--
maqview-0.2.5-r3
710
log
plain
-rw-r--r--
mcl-08.312
938
log
plain
-rw-r--r--
mcl-12.135
938
log
plain
-rw-r--r--
mcl-14.137
619
log
plain
-rw-r--r--
meme-4.11.2_p2
2746
log
plain
-rw-r--r--
mira-4.0.2
1239
log
plain
-rw-r--r--
mosaik-2.2.30
833
log
plain
-rw-r--r--
mothur-1.27.0-r1
911
log
plain
-rw-r--r--
mrbayes-3.1.2-r1
849
log
plain
-rw-r--r--
mrbayes-3.1.2-r2
859
log
plain
-rw-r--r--
mummer-3.23
703
log
plain
-rw-r--r--
muscle-3.8.31
684
log
plain
-rw-r--r--
ncbi-tools-2.2.26-r2
1254
log
plain
-rw-r--r--
newick-utils-1.6
283
log
plain
-rw-r--r--
njplot-2.3-r2
568
log
plain
-rw-r--r--
pals-1.0-r1
387
log
plain
-rw-r--r--
paml-4.4c-r1
494
log
plain
-rw-r--r--
phrap-1.080812-r2
400
log
plain
-rw-r--r--
phred-071220-r1
383
log
plain
-rw-r--r--
phylip-3.69-r1
517
log
plain
-rw-r--r--
phylip-3.696-r1
518
log
plain
-rw-r--r--
phyml-2.4.5-r3
383
log
plain
-rw-r--r--
picard-1.103
1458
log
plain
-rw-r--r--
piler-1.0-r1
478
log
plain
-rw-r--r--
pilercr-1.0-r1
440
log
plain
-rw-r--r--
plink-1.07-r1
783
log
plain
-rw-r--r--
plink-1.90_pre140514
786
log
plain
-rw-r--r--
poa-2-r1
668
log
plain
-rw-r--r--
prank-140603
383
log
plain
-rw-r--r--
primer3-2.3.7
499
log
plain
-rw-r--r--
prints-39.0-r1
396
log
plain
-rw-r--r--
probcons-1.12-r1
757
log
plain
-rw-r--r--
prodigal-2.6.3
402
log
plain
-rw-r--r--
profphd-1.0.39
870
log
plain
-rw-r--r--
profphd-1.0.40
870
log
plain
-rw-r--r--
prosite-2017.02
416
log
plain
-rw-r--r--
psipred-3.2.1
865
log
plain
-rw-r--r--
psipred-3.3
949
log
plain
-rw-r--r--
psipred-3.4
965
log
plain
-rw-r--r--
psipred-3.5
965
log
plain
-rw-r--r--
pysam-0.12.0.1
2569
log
plain
-rw-r--r--
qrna-2.0.3c-r2
439
log
plain
-rw-r--r--
raxml-7.2.6
806
log
plain
-rw-r--r--
rebase-1701
428
log
plain
-rw-r--r--
rebase-1702
467
log
plain
-rw-r--r--
rebase-1703
467
log
plain
-rw-r--r--
rebase-1704
467
log
plain
-rw-r--r--
recon-1.08
462
log
plain
-rw-r--r--
repeatmasker-4.0.1
384
log
plain
-rw-r--r--
repeatmasker-libraries-20120418
290
log
plain
-rw-r--r--
rmblast-1.2-r1
830
log
plain
-rw-r--r--
rnaview-20040713-r4
438
log
plain
-rw-r--r--
samtools-0.1.20-r3
1487
log
plain
-rw-r--r--
samtools-1.5
1371
log
plain
-rw-r--r--
seaview-4.3.5
991
log
plain
-rw-r--r--
seaview-4.5.4
991
log
plain
-rw-r--r--
seaview-4.6
1079
log
plain
-rw-r--r--
seqan-1.4.2-r1
1388
log
plain
-rw-r--r--
seqan-2.2.0-r1
1697
log
plain
-rw-r--r--
shrimp-2.0.1
819
log
plain
-rw-r--r--
shrimp-2.2.3
1324
log
plain
-rw-r--r--
sibsim4-0.20
385
log
plain
-rw-r--r--
sim4-20030921-r2
395
log
plain
-rw-r--r--
snpfile-2.0.1-r2
768
log
plain
-rw-r--r--
stride-20011129-r1
796
log
plain
-rw-r--r--
t-coffee-11.00-r2
545
log
plain
-rw-r--r--
tophat-2.1.1-r4
3279
log
plain
-rw-r--r--
transfac-3.2-r1
434
log
plain
-rw-r--r--
tree-puzzle-5.2
784
log
plain
-rw-r--r--
treeviewx-0.5.1-r3
1031
log
plain
-rw-r--r--
trf-4.04-r1
271
log
plain
-rw-r--r--
trnascan-se-1.31
464
log
plain
-rw-r--r--
uchime-4.2.40
993
log
plain
-rw-r--r--
ucsc-genome-browser-260
1137
log
plain
-rw-r--r--
unafold-3.8-r1
703
log
plain
-rw-r--r--
update-blastdb-12.0.0
503
log
plain
-rw-r--r--
vaal-46233-r2
961
log
plain
-rw-r--r--
vcftools-0.1.14
1168
log
plain
-rw-r--r--
velvet-1.0.18-r1
776
log
plain
-rw-r--r--
velvet-1.2.10
744
log
plain
-rw-r--r--
vienna-rna-2.1.1
2053
log
plain
-rw-r--r--
vienna-rna-2.1.8
2065
log
plain
-rw-r--r--
wgs-assembler-7.0-r1
832
log
plain
-rw-r--r--
wise-2.4.0_alpha
889
log
plain
-rw-r--r--
yass-1.14-r2
750
log
plain